Annelies Willemse studeerde orgel en kerkmuziek aan het Brabants conservatorium bij onder andere Bram Beekman. Daarbij studeerde ze ook in Tilburg koordirectie bij Martien van Woerkum en Louis Buskens. In het kader van haar Tweede Fase studie orgel aan de Zuid-Nederlandse Hogeschool voor muziek studeerde ze bij Jan van de Laar. Masterclasses volgde zij bij onder andere Ludger Lohmann, Liewe Tamminga, Andrea Marcon en Cor van Wageningen.
Ze gaf concerten in ’s-Hertogenbosch, Utrecht, Amsterdam, Arnhem, Middelburg en Helmond.
Helmond
Annelies is actief als organiste en dirigente in de Sint-Jozefkerk te Helmond, waar ze het orgel uit 1788 van de Friese orgelbouwer Albertus van Gruisen bespeelt. Ze begeleidt het Sint Jozefkoor tijdens de gregoriaanse hoogmissen, dirigeert dameskoor Sint Jozef en Capella Musica Sacra, een koor dat zich toelegt op de uitvoering van polyfone renaissance-muziek.
Daarnaast is zij dirigente van het kamerkoor van het Academisch Genootschap in Eindhoven.